Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB3O43889 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB3O43889 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREB3O43889 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB3O43889 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB3O43889 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB3O43889 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB3O43889 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREB3O43889 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms