Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEFVO15553 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEFVO15553 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms