Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR46O15213 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR46O15213 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR46O15213 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
WDR46O15213 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
WDR46O15213 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR46O15213 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR46O15213 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
WDR46O15213 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
WDR46O15213 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms