Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01387J3KSC0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms