Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPIPA5E9PKD4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms