Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IDSB3KWA1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms