Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms