Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRAMEF22A3QJZ6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms