Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM30CPA0ZSE6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms