Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms