Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX8Q9Y5X2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms