Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNPO3Q9Y5L0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNPO3Q9Y5L0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms