Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms