Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms