Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPC1L1Q9UHC9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms