Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms