Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms