Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATAD3AQ9NVI7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms