Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FANCFQ9NPI8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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