Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms