Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPF2Q9HAU5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms