Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM8Q9BZR9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms