Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP58Q9BVL2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms