Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms