Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NICN1Q9BSH3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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