Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GAL3ST1Q99999 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAL3ST1Q99999 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms