Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUDCD1Q96RS6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms