Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM47Q96LD4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms