Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX4I2Q96KJ9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms