Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C18orf8Q96DM3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C18orf8Q96DM3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms