Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RPUSD4Q96CM3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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