Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD1Q8NHV4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms