Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BEST4Q8NFU0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms