Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
APTXQ7Z2E3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APTXQ7Z2E3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms