Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP26C1Q6V0L0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP26C1Q6V0L0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms