Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLC3Q6P597 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms