Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ACBD4-211ENST00000589798 494 ntTSL 510.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SRSF5-210ENST00000555412 572 ntTSL 211.48□□□□□ -0.576e-12■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.257e-7■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MLH1-213ENST00000456676 2230 ntTSL 1 (best)6.96□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.891e-6■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 KLHL26-203ENST00000595423 554 ntTSL 219.35■□□□□ 0.699e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.639e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.599e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MIB2-207ENST00000470373 546 ntTSL 218.55■□□□□ 0.569e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 SNX11-212ENST00000583320 965 ntTSL 315.65■□□□□ 0.19e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MAP7D1-209ENST00000487131 733 ntTSL 515.62■□□□□ 0.099e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.389e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.399e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 312.62□□□□□ -0.399e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.399e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-24■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP9B-210ENST00000587410 871 ntTSL 312.38□□□□□ -0.439e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.449e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 ALG8-208ENST00000526737 1674 ntTSL 512.16□□□□□ -0.469e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.479e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 HAUS2-206ENST00000567640 592 ntTSL 311.94□□□□□ -0.59e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 MAN2A2-212ENST00000559341 623 ntTSL 211.89□□□□□ -0.519e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 411.89□□□□□ -0.512e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SEC23B-205ENST00000422877 834 ntTSL 311.87□□□□□ -0.518e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.522e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 SLC4A11-203ENST00000437836 494 ntTSL 211.79□□□□□ -0.522e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.539e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.569e-9■■■■■ 32.9
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