Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FRMPD1Q5SYB0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms