Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
C5orf47Q569G3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
C5orf47Q569G3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms