Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM259Q4ZIN3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms