Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q1T7F1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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