Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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GEN1Q17RS7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GEN1Q17RS7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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