Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2B3Q16720 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B3Q16720 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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