Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTF1Q16619 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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