Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ECM1Q16610 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ECM1Q16610 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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