Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SGCAQ16586 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SGCAQ16586 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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SGCAQ16586 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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SGCAQ16586 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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SGCAQ16586 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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SGCAQ16586 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGCAQ16586 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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