Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SCARB2Q14108 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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