Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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AP3B2Q13367 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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AP3B2Q13367 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP3B2Q13367 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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AP3B2Q13367 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP3B2Q13367 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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