Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SGCGQ13326 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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