Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPA4Q13156 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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RPA4Q13156 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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RPA4Q13156 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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